יותר משלושה ימים אחרי הטרור בבוסטון, מצוד קטלני אחר החשודים. המשטרה אישרה הבוקר (ו') כי חשוד בפיגוע בבוסטון נהרג במהלך מצוד בעיירה ווטרטאון שליד בוסטון וכי החשוד השני עדיין חופשי. תמונותיהם של החשודים מזירת הפיגוע במרתון פורסמו הלילה. החשוד שנהרג הוא שחבש כובע מצחיה שחור ואילו חברו הנמלט חבש כובע מצחיה לבן לפני הפיצוץ. החשוד הראשון נורה במהלך הפשיטה על העיירה ומותו נקבע בבית החולים. החשוד הנמלט נחשב מסוכן ביותר והמשטרה קראה לתושבים להינעל בבתיהם. שירותי התחבורה הציבורית באזור בוסטון הושבתו לבקשת המשטרה.
שלוש התרחשויות אלימות החרידו בימים האחרונים את אזור בוסטון וכעת מתברר הקשר בין שלושתן. הראשון היה הפיגוע במרתון ביום שני בערב, שבו נהרגו שלושה בני אדם. הרשויות מחפשות מאז אחר החשודים בפיגוע ואמש הציג ה-FBI את תמונותיהם של שני חשודים.
שני אירועים חריגים התרחשו הלילה. בתקרית ירי במכללת MIT בקיימברידג' נורה למוות שוטר. שעות ספורות אחר כך התקבלה קריאה על חטיפת רכב מסחרי
באיומי נשק שהובילה את השוטרים לעיירה ווטרטאון. ה"בוסטון גלוב" דיווח כי מהרכב שנחטף הושלכו מטעני חבלה במהלך ההימלטות. במשך שעות לא היה ברור מה הקשר בין האירועים אך כעת הדבר מתבהר - המבוקשים בפיגוע הם האחראים לירי ב-MIT והם גם חטפו את הרכב ונסעו לשכונה.
בווטרטאון דיווחו עדי ראייה כי שמעו ירי ופיצוצים בסביבות השעה 1 בלילה (8:00 שעון ישראל). מאות שוטרים ואנשי FBI נמצאים בשכונה, מלווים במסוק ובעשרות ניידות.
"להינעל בבית, להתרחק מחלונות"
במסיבת עיתונאים מאולתרת בשטח ובציוצים בחשבון הטוויטר שלה קראה משטרת בוסטון לתושבי השכונה להישאר בבתיהם, לנעול את הדלתות, להתרחק מחלונות ולדווח על זרים. "שוטרים יעברו מדלת לדלת, מרחוב לרחוב, בווטרטאון ובסביבותיה. השוטרים יהיו מזוהים בבירור. המצב נזיל", צייצה המשטרה בטוויטר.
הלילה אמרו ב-MIT כי המשטרה סורקת את הקמפוס בקיימברידג', שם לומדים 11 אלף סטודנטים. היא הכריזה על מצב חירום והנחתה את הסטודנטים להישאר בחדרים שלהם. לבקשת המשטרה, הורה מושל מסצ'וסטס להשבית לעת עתה את התחבורה הציבורית. פעילותם של כל הרכבות והאוטובוסים המובילים לבוסטון הושעו כדי למנוע מאנשים לשהות ברחובות. בתי העסק התבקשו להישאר סגורים. תושבי פרברי בוסטון נקראו להימנע מהתקהלות.
שמותיהם וזהותם של השניים לא פורסמו עדיין, מניעיהם לא ברורים וגם לא הרקע שלהם. הפרט היחיד שאושר בתדרוך בבית החולים הוא שההרוג הוא גבר בוגר. הוא סבל משילוב של פצעי ירי וככל הנראה פציעות שנגרמו כתוצאה מפיצוץ חומרי נפץ. ייתכן שלבו נדם עוד לפני שהגיע לחדר המיון.
הבולשת הפדרלית של ארצות הברית, ה-FBI, פרסמה הלילה את תמונותיהם של שני החשודים בקשר לפיגוע במרתון בבוסטון, וביקשה את עזרת הציבור באיתורם. בתמונות שצילמו מצלמות האבטחה באזור נראו השניים הולכים זה לצד זה דרך הקהל לפני הפיגוע.
הנשיא אובמה הגיע אמש לבוסטון עם אשתו מישל, לטקס לזכר קורבנות הפיגוע במרתון בעיר. "אנחנו נקום ונמשיך, ונסיים את המרוץ", אמר הנשיא האמריקני בנאומו. בפנייה אישית לתושבי בוסטון הוסיף אובמה: "בוסטון אולי היא עירכם, אבל היא שלנו גם. היא אחת מהערים המאפיינות את ארצות הברית. היא אחת מהערים המוכרות בעולם. הסיבה לכך ההיא שבוסטון פותחת את לבה לעולם. לאורך דורות קיבלתם דורות על דורות שנחתו על חופינו. מהגרים שהגיעו להצטרף למדינתנו".