דובר צה"ל מאשר בהודעה רשמית כי המבצע המיוחד לטיהור בית החולים שיפא ממחבלי חמאס וגא"פ (גי'האד איסלאמי) הסתיים הבוקר ובית החולים מטוהר כעת ממחבלים. בהודעה משותפת לצה"ל ולשב"כ נכתב כי 200 מחבלים חוסלו במהלך המבצע וכ-500 נעצרו ונחקרו.
"בשבועיים האחרונים כוחות צה״ל ושב״כ בהובלת אוגדה 162 יחד עם כוחות צק״ח 401, שייטת 13, צק״ח נח״ל ויחידת דובדבן ביצעו מבצע ממוקד בבית החולים שיפא" נמסר בהודעה.
"המבצע נעשה בעקבות מודיעין מקדים ומדויק של אמ״ן ושב״כ על ניהול פעילות של ארגוני טרור ברצועה מהמרחב ושימושו למרכז פיקוד ושליטה ומפקדה צבאית. במבצע חיסלו הכוחות מאות מחבלים ונעצרו מעל 500 מחבלים המזוהים כמשויכיים לארגוני טרור ברצועה. העצורים הועברו להמשך חקירה באגף המודיעין 504 ובשב״כ" סיכמו צה"ל ושב"כ.
בצה"ל חושפים לצד התיעודים את הנתונים: "הכוחות איתרו אמצעי לחימה רבים, מסמכים מודיעיניים ברחבי בית החולים, נתקלו במחבלים בקרבות פנים אל פנים וניהלו קרבות תוך הימנעות מפגיעה בצוות הרפואי ובחולים".
"הבוקר (שני) המשימה הושלמה והכוחות יצאו ממרחב בית החולים. צה״ל ושב״כ ימשיכו לפעול בצפון הרצועה ובכל מקום בו הטרור ירים ראש".
כזכור, במהלך המבצע, והודות למידע שהופק ממחבלים שנעצרו בשיפא, חוסלו בכירים רבים בחמאס, עיתים - דקות ספורות בלבד לאחר מידע שהתקבל בחקירות המחבלים עוד בתוככי הרצועה ובטרם הועברו לישראל.
בצה"ל, במקביל לפעילות המבצעית, פעלו להקמת בתי חולים שדה חלופיים עבור המטופלים, זאת כדי להמנע מפגיעה חפים מפשע - מהלך שהוביל להסכמה בינלאומית להמשך הלחימה בתוככי בית החולים הגדול ביותר ברצועת עזה.
במהלך הלחימה, בצה"ל ובשב"כ עמלו קשות על מנת לספק לעולם ולעזתיים הוכחות על פעילות הטרור הענפה שהתבצעה בחסות בית החולים שיפא. בין היתר חשפו בצה"ל ושב"כ מסמכים ועדויות רבות על הימצאותם של מחבלים - בהם בכירים, בתוך בית החולים.
גם מסמכים המתעדים פגישות של בכירי הארגון בתוככי בית החולים, נחשפו על ידי צה"ל ושב"כ והוצגו לעולם כהוכחות לנחיצות המבצע.
גם בתחום ההומנטירי, בצה"ל השקיעו רבות והכניסו סיוע הומניטרי לסביבת בית החולים, כחלק מהמאמצים להימנע מפגיעה - אפילו עקיפה, בחפים מפשע ובלתי מעורבים בטרור.
הסיוע הוכנס במהלך כל ימי הפעילות המבצעית ונותב לעזתיים שנזקקו לכך, מעל לראשו של החמאס השולט בסיוע ההומניטרי המוכנס לרחבי רצועת עזה.
צה"ל איבד גם מספר לוחמים שנהרגו בהיתקלויות שונות בתוככי בית החולים ובסביבתו, לצד לוחמים נוספים שנפצעו בדרגות שונות.