מאז עזב סגן שר הביטחון אלי בן דהן את לשכת (סגן) שר הדתות לטובת אנשי ש"ס הוא לא מפסיק לכעוס, הוא רואה - לטעמו - כיצד אנשי ש"ס משנים את כללי המשחק לטובת הרבנים החרדים והעמדה החרדית, והוא לא מהסס להתלונן על כך בפני משרד המשפטים - שבשליטת מפלגתו.
הסיבה הנוכחית למחלוקת היא הבחירות לרבני ההתיישבות. במשרד הדתות החליטו לשנות את הרכב גוף הבוחר, כך שלרבנות הראשית ולמשרד הדתות יהיו שלושה מתוך חמישה חברים בגוף הבוחר - זאת בניגוד למהלכים שהוביל בן דהן בזמן כהונתו במשרד.
בן דהן פנה למשרד המשפטים וביקש את התערבותם מאחר ולטענתו מדובר בניסיון להביא לבחירת רבנים חרדים, אלו שיזכו לתמיכת ש"ס.
יצוין כי עשרות ישובים צפויים לזכות בקרוב לרב ישוב חדש לאחר שהתקנים עבורם אושרו.
מנגד, בכירים בתנועת ש"ס המעורים בנושא תוקפים את בן דהן וטוענים כי המהלך נעשה בשיתוף פעולה איתו, אך כעת הוא התרגש מכותרות בתקשורת וחזר בו.
לדברי הבכירים במפלגה החרדית: "כל הנהלים נכתבו בצוותא עם אלי בן דהן ועם משרד המשפטים, בגלל כותרות בתקשורת הוא עשה פתאום פרסה ברגע אחרון לפני ההצבעה וקיבל רגליים קרות, אין לו להלין אלא על עצמו".