בשיעור אותו מוסר הר' אמנון יצחק בבית מדרשו, תקף את הרבנים הראשיים, הראשל"צ הגר"י יוסף והגר"ד לאו במילים קשות קשות, זאת בשל העובדה שהסכימו לפגוש את האפיפיור. לאחר שהשמיט את התואר רב מהראשל"צ אמר הר' יצחק: "הם זכו... זכו, איזה זכות? ללחוץ את ידו של הצלם" (חרדים)