סגל הפיקוד והמערך הרפואי של שב"ס מקיימים הערכות מצב שוטפות על מנת להתעדכן בהתפתחויות בנוגע להתפשטות נגיף הקורונה, לאמוד את הסכנות והמשמעויות הנגזרות ולבחון אפשרויות פעולה נוספות תוך שמירה על רציפות תפקודית ארגונית.
בהמשך להנחיות הדרג המדיני ולאישור תקנות לשעת חירום שאושרו היום ע"י הממשלה וכדי לצמצם ככל הניתן כניסות לבתי הכלא, נערך שב"ס לפעול לקיום דיוני הארכות מעצר באמצעים טכנולוגיים מבתי הסוהר ללא ליווי העצורים לבתי משפט. כמו כן, התייעצות עצורים עם עורכי דין תתקיים ככלל באמצעות שיחות טלפון.
תעסוקת האסירים הותאמה למגבלות משרד הבריאות כמו גם היציאות לחצרות הטיולים והשהייה בשטחים הציבוריים.
בנוסף, נערך שב"ס לטיהור שטחים ציבוריים מחוץ ובתוך אגפי הכליאה. כל איש סגל ואזרח שנדרש באופן חיוני להיכנס לבית סוהר נבדק בכניסה למתקן. הוגדלה מכסת הרכישות בקנטינה לאסירים הפליליים ב 200 ש"ח לחודש והוקמה קרן לסיוע כספי לאסירים נזקקים.
ציוד ניקיון והיגיינה חולק לכלל היחידות ונרכש ציוד נוסף שיחולק בהמשך לחיטוי ולניקיון התאים והאגפים. בנוסף, מתקיימת הסברה שוטפת לכלואים באמצעות סרטוני הסברה במספר שפות, שילוט הסברה וחומרי הסברה נוספים המדגישים את החובה לשמירה על היגיינה. ההנחיות הועברו לכלל הכלואים שרואים עצמם שותפים למאמץ ההתגוננות ומניעת התפשטות הנגיף בתוך בתי הסוהר.
הסברה לסגל מועברת בערוצי התקשורת הארגוניים וכוללת בין היתר הקפדה על הגיינה אישית והכלת צרכי הכלואים בתקופה זו ביתר שאת.
כלל בתי הסוהר נערכו לעבודה במשמרות ארוכות יותר על מנת לצמצם כניסות סגל ונבדקת האפשרות של הפעלת עובדי מנהלה מהבית. נכתבות פקודות הפעלה ייחודיות לעבודה בתקופה זו בכל מגזרי הפעילות הארגונית.