הטלטלה הפוליטית בש"ס משפיעה גם על המפלגה החרדית השכנה, יהדות התורה. בצורה רשמית, מסרבים גורמים במפלגה להתייחס בצורה גלויה לשובו של דרעי, אבל שלא לציטוט הם מודים כי מוטב שישי ימשיך כיו"ר התנועה.
גורם בכיר ביהדות התורה טוען כי חבר הכנסת משה גפני מעדיף לראות את אלי ישי בראשות התנועה. לדבריו, "בקדנציה האחרונה נרשם שיתוף פעולה מלא לחלוטין בין שתי המפלגות החרדיות. הם תיאמו עמדות ויצאו למאבקים משותפים מתוך אחדות מוחלטת. את זה אפשר לייחס לאלי ישי, שחיזק את הציר עם בתי האדמו"רים וראשי הישיבות הליטאים.
הגורם מוסיף: "בכל מאבק שניהלנו - הדיור, הגיור, חוק רבני צוהר וגם בנושאי גיוס בחורי הישיבות, אלי ישי מבחינתנו סיפק את הסחורה".
בכיר נוסף ביהדות התורה מזכיר את הקשר המיוחד שנרקם בין אנשי ביתו של מרן ראש הישיבה הגראי"ל שטיינמן שליט"א לתנועת ש"ס. "בזכות אלי ישי, עברו לא מעט מסרים בין הבתים של גדולי ישראל דרך ישי. גם עם חסידות בעלזא התהדק הקשר רבות בזכות שר הפנים".
למרות החיבה שרוחשים ביהדות התורה לישי, הגורם מציין את הקשר הטוב בין ליצמן וגפני לדרעי. "שניהם", אומר הגורם, "שועלים פוליטיים ומכירים את אריה דרעי שנים רבות. שיתוף הפעולה יכול להיות הדוק ומועיל".