הוא היה האיש החזק במשק, אך בחודשים האחרונים הוא מרצה עונש מאסר בפועל בכלא מעשיהו, בשל הרשעתו בפרשת הרצת המניות. בכלא הוא מתחזק ואף מדרבן אסירים להתפלל במניין.
אסיר, שהיה שותף לתא עם דנקנר, סיפר ל'חדשות 12': "הוא איש מאמין, מאמין שזו גזירה שנגזרה, הוא קורא כל שבוע את ספר קהלת ואת ספר משלי. ויש ימים שהוא קורא פרקי שירה מהתנ"ך. זה היה התפילות שלו ותהילים".
לדבריו: "הוא היה מארגן את כולם בתור ה.. מניין, היה לו מניין מצומצם. לא תמיד היינו יכולים אז הוא היה מדרבן את כולם שיבואו למניין".
אסיר אחר הוסיף: "הוא אדם מאמין, חזק באמונה, עוד מלפני ומראש. בתפילות, חשוב שכולם יהיו.. חשוב שכולם יהיו ביחד, בסיפורי דת.. סיפורי ההיכרות שלו עם גדולים בתורה".
כזכור, עם כניסתו לכלא אמר דנקנר: "המעמד כאן הוא יום קשה לי ולמשפחתי. נלחמתי על חפותי. אני מאמין בקב"ה שהכל לטובה, בוטח במערכת הצדק והמשפט ואוהב מאוד את מדינת ישראל".