המחבל המצרי שחדר לשטח ישראל, חצה דרך פתח החירום שהיה קשור באזיקונים בלבד וללא תלתלית. בכליו, נמצא ספר הקוראן, ובצה"ל מעריכים שזה מלמד על ההקצנה הדתית שעבר שהובילה את המחבל לביצוע הפיגוע.
לפי הדיווח של דורון קדוש בגלי צה"ל, בכליו של המחבל נמצאה הסכין איתה חתך את האזיקונים בפתח החירום, ובנוסף, שש מחסניות שמעידות על תכנון מוקפד לביצוע הפיגוע.
במהלך חילופי האש, שהחלו שעות לאחר שהרג את שני הלוחמים סמל ליה בן נון וסמ"ר אורי יצחק אילוז ז"ל, הוקפצו מסוקי קרב כדי לסייע במרדף, אך לפי הדיווח של יוסי יהושע ב-ynet, המסוקים איחרו להגיע.
הכוח, בראשות מפקד האוגדה תת-אלוף איציק כהן, התקדם בלי המסוקים והחל "לסגור מעגל" על המחבל. הם הסתערו עליו, אך לפי הדיווח של דורון קדוש, המחבל - שזוהה על ידי הרחפן הצה"לי, היה הראשון שפתח באש.
במהלך חילופי האש, המחבל הצליח להרוג את הלוחם השלישי, סמ"ר אוהד דהן ז"ל, ומיד חוסל.
חלק מהמחדלים שייבדקו הם האם ההחלטה להתקדם ולהסתער על המחבל ללא הסיוע האווירי היתה נכונה. ובנוסף, ההיתקלות השניה התרחשה לאחר שהמחבל זוהה על ידי רחפן, ותועד בכל צעדיו. הכוח ידע שמדובר במחבל חמוש - ולמרות זאת הכוח הופתע והמחבל הצליח להרוג לוחם.
לפי מה שידוע עד כה, בשעה 02:30 בלילה סיכלו הכוחות, הישראלים והמצרים, הברחה של סמים. צה"ך נפרס בשטח, בצמדים, החל מהשעה 21:00 בערב.
המחבל, כאמור, נכנס דרך מעבר החירום שהיה סגור באזיקונים. הוא כנראה ידע היטב היכן פתחי החירום ואיך הם סגורים, וניצל זאת כדי לחדור לישראל.
הקשר האחרון עם שני הלוחמים בעמדה היה בסביבות השעה 04:15 לפנות בוקר. רק כעבור חמש שעות, סביב השעה 09:00 בבוקר, לאחר שלא נוצר איתם קשר - מפקדת המחלקה מצאה אותם ירויים למוות והוכרז על חדירת מחבלים.
הלוחמים, כך עולה מהתחקיר הראשוני, לא הספיקו להגיב למחבל שהפתיע אותם בעמדה ולא פתחו לעברו באש.
במהלך הסריקות אחר המחבל, הרחפן הצ"הלי זיהה את המחבל - קילומטר וחצי בעומק ישראל, שם הוא חוסל בסופה של היתקלות, במהלכה הצליח להרוג לוחם נוסף.
צה"ל, היה בעליונות מול המחבל - אך הוא לא חוסל מהאוויר, כאמור, בין היתר בשל האיחור בהגעת המסוקים, ולמרות שהיה תחת תצפית של הרחפן, הוא לא חוסל, מה שעיד על כשל בהתנהלות הכוחות.
בין היתר בודקים בצה"ל למה חדירת המחבל דרך פתח החירום לא זוהתה, מדוע לא נבדק הקשר עם הלוחמים בכל שעה. כמו כן יבדקו את האיחור בהגעת המסוקים וההחלטה להסתער על המחבלים ללא חיפוי אווירי.
היום יובאו שלושת הלוחמים למנוחות. הלוויתה של סמל ליה בן נון ז"ל, תערך בשעה 16:30 בבית העלמין הצבאי בעיר ראשון-לציון. הלוויתו של סמל-ראשון אורי יצחק אילוז ז"ל, תערך בשעה 17:00 בבית העלמין הצבאי בעיר צפת. הלוויתו של סמל-ראשון אוהד שמעון דהן ז"ל, תערך בשעה 17:00 בבית העלמין הצבאי בעיר אופקים.
הרמטכ"ל רב-אלוף הרצי הלוי, קיים אמש הערכת מצב בחטיבה המרחבית פארן. הוא תחקר במקום את השתלשלות האירועים לאורך היום יחד עם מפקד פיקוד הדרום, אלוף אליעזר טולדנו, מפקד אוגדה 80, תת-אלוף איציק כהן, וראש חטיבת תבל, תת-אלוף אפי דפרין.
"מדובר באירוע קשה", אמר הרמטכ"ל, "במהלכו נפלו שני לוחמים ולוחמת צה"ל, מטובי בנינו ובנותינו בפעילות מבצעית לשמירה על הביטחון בגבול מצרים. בסיומם של חילופי אש, בהם חתרו לוחמי צה"ל למגע, המחבל נהרג. האירוע מתרחש בגבול בו מתבצעות פעילויות מבצעיות מדי לילה.
"אנו מתחקרים את האירוע בצורה יסודית ומעמיקה, יחד עם צבא מצרים, ונפיק את הלקחים הנדרשים. הלוחמים והלוחמות מילאו את תפקידם ומנעו בפעילותם פגיעה נוספת בכוחות ובעורף הישראלי. מבקש מכאן לחזק את המשפחות על האובדן".
בהמשך היום שוחחו שר הביטחון יואב גלנט ושר ההגנה המצרי, רב-אלוף מוחמד אחמד זכי, שוחחו בעקבות פיגוע הירי הקשה. השר גלנט הביע את הערכתו למחויבות שר ההגנה המצרי לחקירה משותפת של פרטי האירוע החמור, והדגיש את חשיבות שיתוף הפעולה בחקירת הפיגוע למניעת מקרים נוספים בעתיד.
שר הביטחון גלנט אמר לשר ההגנה המצרי כי מערכת היחסים בין ישראל למצרים חשובה מאוד לשתי המדינות, וכי על שני הצדדים לוודא שהאירוע הקשה לא יפגע במערכת היחסים הביטחוניים הטובה בין המדינות.